年初成立，隶属国家安全生产监督管理总局，国家安全生产监督管理总局党组成员、副局长王德学任国家安全生产应急救援指挥中心主任。
2006年10月1日：《危险化学品建设项目安全许可实施办法》《烟花爆竹经营许可实施办法》经国家安全生产监督管理总局局长办公会议审议通过并公布，《办法》自2006年10月1日起施行。原国家安全生产监督管理局《危险化学品生产储存建设项目安全审查办法》同时废止。
2006年10月8～11日：在京召开的中国共产党第十六届中央委员会第六次全体会议，对当前和今后一个时期构建社会主义和谐社会作出了部署，其中要求，要统筹协调各方面利益关系，完善应急管理体制机制，加强安全生产。国家安全监管总局局长李毅中10月13日在传达、学习六中全会精神时指出：全会高度重视安全生产问题，进一步坚定了我们努力实现安全生产形势明显好转的信心。下一步，我们要细化分解“十一五”安全生产规划确定的重要目标任务，遏制重特大事故，深化煤矿两个攻坚战和重点行业领域的专项整治，加快探索和实施各项治本之策，加强对煤矿等重点行业企业安全基础工作的指导监督，继续推进安全生产源头治本、政策治本，大力加强基础工作与基层建设。
2006年11月22日：《安全生产领域违法违纪行为政纪处分暂行规定》经监察部2006年10月30日第8次部长办公会议、国家安全生产监督管理总局2006年9月26日第23次局长办公会议通过，予以公布，自11月22日起施行。该规定的颁布实施，将有利于规范安全执法行为，有利于打击失职渎职和权钱交易、官商勾结等腐败行为，有利于从源头上防范生产安全事故的发生。
2006年12月8日：财政部、国家安全监管总局出台了《高危行业企业安全生产费用财务管理暂行办法》，自2007年1月1日起施行。
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